《潛艇總動員[1]》講述的是兩只實習小潛水艇阿力和貝貝的深海曆險故事。這兩個小夥伴在人類教練道哥的指導下，開始在神秘莫測的深海裏執行巡邏任務。每天他倆都努力完成教練布置的各項任務，期待著有一天能夠從實習生晉級爲科研潛水艇。實習過程中，他們常常遇到各種險情，比如，教練道哥被卡在深海海底岩縫中，偶像德叔發動機發生故障掉進岩石裏，飛機蘇喜被濃霧圍困等待緊急救援。
除了危機四伏，兩個小夥伴也遇到了很多有趣的狼狽場面，搬運海參時被噴了一身稠糊糊的黏液，運送電鳗被電擊得到處亂竄，而費好大勁建好的停靠站轟然倒塌變回一堆零件。阿力和貝貝的兩個好朋友——水下腳踏車石頭和他身上的寄居蟹布丁，也時不時地給阿力和貝貝幫倒忙。困難危機一次次考驗著四個小夥伴的智慧和膽量，在戰勝困難的過程中，他們增長了知識，積累了經驗，增進了友誼，學會了合作，懂得了愛與勇氣能夠戰勝內心的恐懼，也明白了只要肯努力
